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組織解離液的選擇與優(yōu)化:從原代細(xì)胞分離到單細(xì)胞測序

更新時(shí)間:2025-12-04點(diǎn)擊次數(shù):353
  在現(xiàn)代生物醫(yī)學(xué)研究中,原代細(xì)胞的獲取是連接組織樣本與下游功能分析(如單細(xì)胞RNA測序)的關(guān)鍵第一步。而組織解離液——即用于將實(shí)體組織分解為單細(xì)胞懸液的酶混合物或化學(xué)試劑——其選擇與優(yōu)化直接決定了細(xì)胞得率、活性及轉(zhuǎn)錄組保真度。因此,合理設(shè)計(jì)解離方案已成為單細(xì)胞組學(xué)研究中的核心技術(shù)環(huán)節(jié)。
  不同組織類型因其細(xì)胞外基質(zhì)(ECM)成分、細(xì)胞間連接強(qiáng)度及細(xì)胞類型組成差異,對解離條件的需求迥異。例如,肝臟富含膠原蛋白,需較高濃度的膠原酶;而腦組織神經(jīng)元脆弱,應(yīng)避免強(qiáng)機(jī)械剪切和長時(shí)間酶處理。常用的解離酶包括膠原酶(Collagenase)、胰蛋白酶(Trypsin)、分散酶(Dispase)、透明質(zhì)酸酶(Hyaluronidase)以及DNase I(降解釋放的DNA以降低黏度)。這些酶可單獨(dú)使用,但更常見的是根據(jù)目標(biāo)組織特性進(jìn)行組合,形成定制化解離液。
  解離液的優(yōu)化需兼顧效率與溫和性。過度解離會(huì)損傷細(xì)胞膜、激活應(yīng)激通路,甚至誘導(dǎo)凋亡相關(guān)基因表達(dá),從而干擾單細(xì)胞測序結(jié)果的真實(shí)性;而解離不足則導(dǎo)致細(xì)胞團(tuán)塊殘留,影響微流控平臺的捕獲效率。為此,研究者常通過預(yù)實(shí)驗(yàn)系統(tǒng)評估不同酶配比、作用時(shí)間、溫度及機(jī)械輔助方式(如吹打、振蕩)對細(xì)胞活力(通常以臺盼藍(lán)染色或流式檢測Annexin V/PI判斷)和得率的影響。
  近年來,商業(yè)化的組織解離試劑盒(如Miltenyi Biotec的Tumor Dissociation Kit、STEMCELL Technologies的Lung Dissociation Kit等)提供了標(biāo)準(zhǔn)化起點(diǎn),但往往仍需針對特定樣本進(jìn)行微調(diào)。例如,在腫瘤微環(huán)境研究中,為保留免疫細(xì)胞亞群完整性,常在解離液中加入蛋白酶抑制劑或抗氧化劑以減少非特異性激活。此外,冷活性酶(cold-active proteases)的應(yīng)用也逐漸興起,可在4°C下實(shí)現(xiàn)溫和解離,有效抑制應(yīng)激基因表達(dá)。
  進(jìn)入單細(xì)胞測序流程后,解離質(zhì)量的影響更為顯著。低質(zhì)量的單細(xì)胞懸液不僅導(dǎo)致細(xì)胞捕獲失敗,還可能引入技術(shù)噪音。已有研究表明,解離過程中激活的FOS、JUN等即刻早期基因(IEGs)會(huì)在scRNA-seq數(shù)據(jù)中形成“假陽性”信號,誤導(dǎo)細(xì)胞狀態(tài)判讀。因此,部分實(shí)驗(yàn)室采用RNA穩(wěn)定性增強(qiáng)劑(如RNAlater)或在解離緩沖液中添加轉(zhuǎn)錄抑制劑(如Actinomycin D)以控制此類干擾,盡管后者需謹(jǐn)慎評估其對細(xì)胞活性的影響。
  組織解離液的選擇并非“一刀切”,而是需結(jié)合組織來源、研究目的及下游技術(shù)平臺進(jìn)行系統(tǒng)優(yōu)化。理想解離方案應(yīng)在短時(shí)間內(nèi)獲得高活性、高純度且轉(zhuǎn)錄組擾動(dòng)最小的單細(xì)胞懸液。未來,隨著人工智能輔助實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)與高通量篩選平臺的發(fā)展,解離條件的個(gè)性化定制將更加精準(zhǔn)高效,為單細(xì)胞多組學(xué)研究提供堅(jiān)實(shí)基礎(chǔ)。

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